Magnetic Proteomics Sample Prep (MPSP) Kit
界面活性剤・変性剤との高い適合性、ビーズ上での高効率な消化、網羅的なプロテオームカバレッジ
- 界面活性剤や変性剤を含む任意の溶解バッファーに対応し、ワークフローとの高い互換性を実現
- 網羅的なプロテオーム解析に不可欠な微量タンパク質の回収効率を最大化
- 沈殿法やフィルター法など従来法を超える、自動化対応設計によるワークフローの簡素化
- 他の磁気ビーズ製品を上回る磁気応答性による、効率的かつ確実なビーズ操作
Catalog Number:
Size
Catalog Number: CS3325A04
ボトムアッププロテオミクスのためのSP3ベース磁気ビーズでタンパク質サンプル調製を簡素化
Magnetic Proteomics Sample Prep (MPSP)ビーズは、広く採用されているSP3（Single-Pot, Solid-Phase–enhanced Sample Preparation）法に基づいた磁気ビーズであり、ボトムアッププロテオミクスワークフローにおける効率的かつ高信頼なタンパク質サンプル調製を実現します。MPSPビーズは、界面活性剤や変性剤を含む多様なバッファーへの高い適合性を持ち、さまざまなワークフローへのシームレスな統合が可能です。また、優れた磁気応答性により、他の技術を上回る効率的で扱いやすいビーズ操作を可能にします。
さらに、低発現タンパク質の回収に最適化されており、網羅的な解析に必要な深いプロテオーム解析を支援します。MPSPビーズは、オンビーズ消化に対応しており、サンプルロスを最小限に抑えつつ、再現性を最大限に高めることができます。自動化対応かつスケーラブルな設計により、沈殿法、FASP、S-Trapといった従来法に代わる簡便な前処理手段として、手動および自動プラットフォームのどちらでも柔軟に対応します。
MPSPビーズをプロテオーム解析ワークフローに取り入れることで、高品質で再現性の高いデータを取得でき、柔軟性と効率性を兼ね備えた解析が可能となり、幅広い研究分野における新たな発見を後押しします。
SP3ベースのMPSPビーズと他社磁気ビーズの比較
SP3法ワークフローにおけるMPSPビーズと他社製品のペプチド回収率の比較 ヒトK562細胞からLysis Buffer (Whole Cell)を用いて抽出したタンパク質に、プロメガのMPSP磁気ビーズ（タンパク質：ビーズ比 = 1:10）およびアセトニトリル（最終濃度80%）を加えて混合した。混合物は1200rpmで20分間振とう後、磁気分離し、80%エタノールで3回洗浄した。その後、Trypsin/Lys-C Mix（酵素：基質比 = 1:20）を含むDigestion Bufferを用いて一晩消化を行った。ペプチド濃度は、プロトタイプの消化バッファー中にスパイクインしたプロメガのK562ペプチド消化物を標準として、Thermo Scientific Pierce 定量比色ペプチドアッセイにより測定した。
同定タンパク質数
総ペプチド数
消化効率
SP3ベースのMPSPビーズと他社磁気ビーズを用いたK562タンパク質の比較プロテオーム解析 消化ペプチドは、C18カラム（0.075 × 50 cm, Acclaim PepMAP［Thermo］）にロードされ、80%アセトニトリルを使用した2–32%のグラジエント条件で2時間分離を行った（Vanquish Neo LC system［Thermo］を使用）。質量分析データは、Thermo Exploris 240質量分析計により、データ依存取得モード、サイクル時間1秒で取得した。得られたRAWファイルは、Proteome Discoverer 3.1にて、Sequest検索エンジン（プレカーサー検出器を含む）を用い、Human Uniprotデータベースに対して検索を実施した。全データは、タンパク質1%、ペプチド0.1%のFDRを基準にフィルタリングした。
ビーズ比較
脱塩比較
ビーズによる捕捉は表面に依存せず、SP3ベースのMPSP、S-Trap、沈殿法を含む脱塩法間で同定されたタンパク質が重複 パネルA：V3種類のビーズを比較したベン解析。中央の領域は、すべてのビーズに共通して同定されたタンパク質を示しており、同定されたタンパク質の95%以上が3種類すべてのビーズに共通していることから、ビーズによる捕捉は特定の表面特性に依存しないことが示唆される。パネルB：3つの代表的な脱塩法（MPSPビーズ捕捉、S-Trap、沈殿法）を比較したベン解析。この解析では、同定されたタンパク質の約83%が3手法すべてで共通であり、約7%がそれぞれのワークフローに固有であることが示されている。いずれの解析も6反復で実施された。
プロトコル
No protocols available
仕様
Catalog Number:
選択製品の構成品内容
| Item | Part # | Size | Concentration |
|---|---|---|---|
Lysis Buffer (Whole Cell) |
CS3325A01 | 1 × 25ml | |
Digestion Buffer |
CS3325A05 | 1 × 25ml | |
MPSP Magnetic Beads Slurry |
CS3325A03 | 1 × 5ml | 20mg/ml in 20% ethanol |
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