LMR MSI Analysis System

困難なサンプルタイプにおけるマイクロサテライト不安定性ステイタスを明瞭化

不安定性(MSI:microsatelliteinstability)を検出するための蛍光マルチプレックスPCRをベースにした方法です。この不安定性はDNA複製中に起こる繰返しユニットの挿入または欠失およびこれらのエラーを修正するミスマッチ修復機構(MMR:mismatchrepairsystem)の不具合によるものです。MSI分析には、通常、ガンおよび正常サンプルから増幅したマイクロサテライトマーカーのアレルプロファイルの比較が伴います。ノーマルサンプルでは認められない新しいアレルがガンサンプルに現れた場合、MSIの存在を示しています。

LMR MSI Analysis Systemは、固形腫瘍のマイクロサテライト不安定性（MSI）を検出するためのPCRベースの方法であり、研究者がサンプルのMSIステータスをより正確に判定できるようにするために開発されました。この改良された判定性は、曖昧な結果や小さなシフトなどの微妙なMSI表現型を持つ挑戦的なサンプルに理想的です。

MSI applications include analysis of solid tumors, lynch syndrome samples and immuno-oncology research and

ロングモノヌクレオチドリピートマーカーによるMSI検出能力の向上

新しいLMRパネルは、4つのPromegaゴールドスタンダードMSIマーカー（BAT-25、BAT-26、MONO-27、および NR-21）と、繰り返し長が増加した4つの追加マーカー（BAT-52、BAT-56、BAT-59およびBAT-60）で構成されています。これらのマーカーの組み合わせにより、従来のマーカーを使用して収集されたデータとの重複を維持しながら、困難なサンプルでのMSI検出能力が向上します。本アッセイは、FFPE組織などの難しいサンプルからでも、すべてのマーカーの強力でバランスの取れた増幅を可能にするように最適化されています。

Validation of LMR Markers for MSI Detection

A recent paper published by Johns Hopkins details how a research team, led by Dr. James R. Eshleman, conducted a validation of the LMR MSI Analysis System using a variety of tumor samples with previously confirmed dMMR/MSI-H status. Additionally, the study showed that the LMR markers demonstrated improved sensitivity for tumor samples that had inconclusive results in previous MSI testing. The study was supported in part by the Promega Clinical Research Program (PCRP) and is the first publication to result from a PCRP partnership.

Read the Paper on PubMed

LMR MSI分析ワークフロー

通常、研究室ではサンプルのインプットからMSIステータスの決定まで、一晩から2日までの時間を要します。LMR MSI Analysis System を使用すると、分析可能なデータを一晩で取得できます。

DNA 精製

5 時間（インキュベーションを含む）

Maxwell® RSC 自動核酸精製装置および Maxwell® RSC FFPE DNA Kit

増幅

約１時間

MSI Workflow: Microsatellite instability markers amplified

LMR MSI Analysis System

キャピラリー電気泳動

約 30 分

MSI Workflow: Capillary electrophoresis step

プロメガ社 Spectrum Compact や Applied Biosystems® 3500 Genetic Analyzer など

データ分析

< 1 時間

分析ソフトウエア

Explore additional MSI products and resources.

明確で信頼性の高いMSIステータス判定

MSI分析では、通常、腫瘍サンプルと正常サンプルのペアを増幅することによって生成されたマイクロサテライトマーカーの対立遺伝子プロファイルを比較します。正常なサンプルには見られない腫瘍サンプルの対立遺伝子の存在は、MSIを示しています。

子宮内膜がん腫瘍サンプル（パネルA〜D）および対応する正常サンプル（パネルE〜H）は、LMR MSI Analysis System を使用して増幅した。フラグメント分析は、Applied Biosystems® 3500 Genetic Analyzer および GeneMapper®ソフトウェアを使用して実行した。赤い矢印は、通常のサンプルには存在しない対立遺伝子を示す。4つの新しい LMRマーカー（BAT-52、BAT-56、BAT-59、およびBAT-60）は、通常のサンプルでは複数のピークがあり、ヘテロ接合性になりやすい。腫瘍サンプルを対応する正常な参照サンプルと比較した後、マイクロサテライト不安定性がすべてのマーカーで認められ、MSI-high（MSI-H）と見なされた。

マーカーによるシフトサイズを示す代表的なサンプル

Allele shift size for MSI-high endometrial cancer tumor sample

MSI Marker shift comparison for long mononucleotide markers — 表はMSI-高子宮内膜がん腫瘍サンプルの平均対立遺伝子シフトサイズを示す。LMRマーカーでの対立遺伝子サイズのシフト（平均= 22.6bp）は、従来の短いマーカーで検出されたシフト（平均= 7.0bp）よりも大きいことに留意。

ロングマーカーはMSIに異なる視点を提供

Tumor and normal endometrial cancer samples analyzed using the LMR MSI Analysis System — LMR MSI Analysis System を使用して、腫瘍と正常な子宮内膜がんサンプルの一致するペアを分析した。ゴールドスタンダードマーカーでは、不安定なローカスで分類が難しい小さなシフト（括弧で示されている）を示した。LMRマーカーでは、LMR ローカスが長いほどシフトが大きくなり、曖昧さが低減。

LMR MSI分析システムが研究室でどのように機能するか？

Our team is dedicated to partnering with you to ensure success and has broad experience training laboratories. We offer an online user training course as well as an in-person training option to get your lab up and running efficiently with the LMR MSI Analysis System.

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MSI分析は、研究および腫瘍スクリーニングにおける貴重なツールです。

MSI as a Research Marker for Immunotherapeutic Response. Presented at the 2017 Annual Meeting of the Association of Molecular Pathology by Dr. James R. Eshleman.

Universal Tumor Screening for Lynch Syndrome: Past, Present and Future. Presented in 2018 by Heather Hampel, MS, LGC.

GeneMapper®ソフトウェア用のMSIパネルとビンは、一貫したデータ分析のためにダウンロードしてご利用いただけます。パネルとビンのテキストファイルは、GeneMapper®4.0、4.1、5.0、および6.0ソフトウェアを使用して遺伝子型の自動割り当てを提供することにより、データ分析を簡素化および標準化します。

パネルおよびビンのダウンロードはこちら

プロトコール

Complete Protocol

LMR MSI Analysis System Technical ManualPDF (4364 KB) – English

選択製品の構成品内容

Item	Part #	Size	Concentration	Available Separately
LMR MSI 5X Primer Mix	MD232A	1 × 200μl
LMR MSI 5X Master Mix	MD233A	1 × 200μl
2800M Control DNA	DD710A	1 × 25μl	10ng/μl	View Product
WEN Internal Lane Standard 500	DG500A	1 × 200μl		View Product
Water, Amplification Grade	DW099A	1 × 1,250μl		View Product

SDS

Search for SDS

分析証明書

Search by lot number

使用制限

For Research Use Only. Not for Use in Diagnostic Procedures.

保存条件

パテントおよび免責条項

TMR-ET, CXR-ET and WEN dyes are proprietary.

技術資料

技術記事

サイテーション

Acquired RAS or EGFR mutations and duration of response to EGFR blockade in colorectal cancer.
--
2016 Nat. Commun.
See all citations

その他

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Part Numbers: MD2540

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