NG2001_ProNex--Size-Selective-Purification-Sys_3 NG2002_ProNex--Size-Selective-Purification-Sys_3 Pronex-size-selective-DNA-purification-system-NG2003

NGSおよびPCRのための優れたサイズ選択と回収率

  • 特異性の高いサイズ選択
  • 優れたDNA回収率
  • 低粘度かつ高速な磁石への吸着により、正確なピペッティングが容易に

Catalog Number:

Size

Catalog Number: NG2001

Please Enquire

Catalog Number: NG2002

Please Enquire

Catalog Number: NG2003

Please Enquire


Overview
Protocols
Specifications
Resources
Related Products
Citations

効率的で精確なサイズ選択

ProNex® Size-Selective Purification Systemは、NGSPCRおよび一般的な分子生物学アプリケーションのための二本鎖DNAの磁気ビーズによる迅速で効率的な精製を可能にします。ProNex® Systemはユーザーが100bp~750bp間で必要とするサイズの精製された二本鎖DNAフラグメント選択を可能にします。その新たな試薬組成は、従来の二本鎖DNA精製法に比べて大きく改善された選択性、再現性と収率をもたらします。更に、ProNex® Systemはマニュアル法でも、自動化ハイスループットのワークフローのどちらでも使用できます。

ProNex Size-Selective DNA Purification System

DNAサイズをコントロール

サンプルに対して加えるProNex® Size Selection Chemistryの比率を変えることにより、保持または排除されるDNAのサイズをコントロールできます。このことは、NGSライブラリとPCRフラグメントのクリンアップやライブラリの二重サイズ選択を可能にします。

DNA Purification and DNA Size Selection

優れたDNA回収率

ProNex NGS Library Prep versus AMPure DNA Recovery

連続バッファー交換/クリンアップ精製におけるProNex® Size-Selective DNA Purification System AMPure® XPビーズの比較。5回の連続クリンアップ(AMPure® XP = 1.8x ratio, ProNex® = 3x ratio)200bp DNAステップラダーに実施。比率は全てのフラグメントを保持するように設定。サンプルあたりN=8で実施。

敏感で精確な単一サイズクリンアップ

DNA Size Selection Chemistry:Sample Ratios

異なるProNex® Chemistry:サンプル比でのDNAサイズ選択

簡単なピペット操作、迅速なビーズ応答

有意に低い粘性‐ピペットチップへの粘着無し

ProNex®ビーズ(左)はAMPure®XPビーズ(右)よりも粘度が大幅に低いため、正確かつ容易にピペット操作ができ、サイズ選択と回収の再現性が向上します。

5倍速いビーズ応答時間‐その違いは明らか

ProNex® ビーズ (下)はAMPure® XP ビーズ (上)よりも磁気反応時間が約5倍速く、より固いペレット形成ができるため、サンプルの取扱いにより確信が持てます。

より正確なライブラリの二重サイズ選択

かける費用に対して最大のシークエンスデータを得るためには、ライブラリの精確なサイズ選択が必要です。望ましいサイズ以外の小さなフラグメントや大きなフラグメントの除去は、不要なリードへの浪費を避けるためには不可欠です。ProNex® Size Selective Purification Systemは既存の方法よりも多くの低分子および高分子のDNAを除去するばかりでなく、必要とする目的フラグメントサイズをより多く保持します。

ProNex NGS Library v AMPure DNA Size Selection Panel A
ProNex NGS Library v AMPure DNA Size Selection Panel B
AMPure v ProNex NGS Library DNA Size Selection Panel C
DNA Size Selection ProNex NGS Library v AMPure Panel D

大腸菌のライブラリがIllumina®NEBNext® Ultra™ II DNA Library Prep Kit を用いて、1,000ng, 100ng, 10ng および1ngの出発試料から調整されました。ライブラリはAMPure® XP ビーズまたはProNex® Size-Selective Purification Systemを用いてサイズ選択されました。AMPure® XP ビーズでメーカーの推奨する方法およびProNex® Size-Selective Purification Systemに対するプロメガのガイドラインに従って300bpを中心にライブラリは選択されました。ProNex® Systemを用いて作成されたライブラリは明らかに高分子量DNAのキャリーオーバーが減少しており、よりタイトなサイズ分布を生成しました。

極めて高いライブラリ収率

DNA Purification and Higher Library Yields

ProNex® Size-Selective Purification System AMPure® XP ビーズとのトータルライブラリ収率。大腸菌のライブラリがIllumina®NEBNext® Ultra™ II DNA Library Prep Kit を用いて、1,000ng, 100ng, 10ng および1ngの出発試料から調整されました。ライブラリはAMPure® XP ビーズまたはProNex® Size-Selective Purification Systemを用いてサイズ選択されました。AMPure® XP ビーズでメーカーの推奨する方法およびProNex® Size-Selective Purification Systemに対するプロメガのガイドラインに従って300bpを中心にライブラリは選択されました。ライブラリサイズ選択後のトータル収率が示されています。

より良いライブラリ調整=望ましいシークエンシングデータ

ProNex® Chemistryは、選択した範囲外のフラグメントの混入を最小限に抑え、希望するフラグメントサイズをより狭い範囲で取得することができます。レンジを狭めることで無駄なリードを減らし、より効率的なシーケンシングを可能にします。

ライブラリフラグメントサイズ分布の比較

ProNex NGS Library Preparation versus AMPure 1000ng
ProNex NGS Library Prep versus AMPure 100ng
ProNex NGS Library Preparation versus AMPure 10ng
ProNex NGS Library Prep versus AMPure 1ng

シーケンスメトリクスの比較 (1,000ng Sample Inputs)

NGS Sequencing Metrics ProNex versus AMPure
Next Generation Sequencing Metrics Comparison

Specifications

Catalog Number:

選択製品の構成品内容

Item Part # Size Available Separately

ProNex® Size-Selective Chemistry

NG103A 1 × 10ml

Wash Buffer

NG105A 1 × 15ml View Product

Elution Buffer (10mM Tris [pH 8.5])

NG116A 1 × 10ml

分析証明書

Search by lot number

使用制限

For Research Use Only. Not for Use in Diagnostic Procedures.

保存条件

DD

See Protocol for detailed storage recommendations.

選択製品の構成品内容

Item Part # Size Available Separately

ProNex® Size-Selective Chemistry

NG103B 1 × 125ml

Wash Buffer

NG105B 1 × 180ml View Product

Elution Buffer (10mM Tris [pH 8.5])

NG116B 1 × 125ml

分析証明書

Search by lot number

使用制限

For Research Use Only. Not for Use in Diagnostic Procedures.

保存条件

DD

See Protocol for detailed storage recommendations.

選択製品の構成品内容

Item Part # Size Available Separately

ProNex® Size-Selective Chemistry

NG103B 4 × 125ml

Wash Buffer

NG1051 2 × 340ml View Product

Elution Buffer (10mM Tris [pH 8.5])

NG116B 4 × 125ml

分析証明書

Search by lot number

使用制限

For Research Use Only. Not for Use in Diagnostic Procedures.

保存条件

DD

See Protocol for detailed storage recommendations.

Resources

Poster: ProNex® Size-Selective Purification System for dsDNA fragment purification and automation on the CyBio FeliX from Analytik Jena

pronex-size-selective-purification-system

Product Citations

Recent publications that mention the use of this product.

View PubMed Citations