標的タンパク質分解(TPD)
標的タンパク質分解(TPD)は、タンパク質の活性を阻害するのではなく、細胞内から除去することでタンパク質の機能を調節するアプローチです。この手法では、細胞が本来備えているユビキチン–プロテアソームシステム(UPS)を利用し、疾患に関与するタンパク質や、従来の阻害剤では標的化が難しいタンパク質を分解します。
PROTACや分子糊(molecular glue)などの分子は、標的タンパク質とE3リガーゼを近接させることで、そのユビキチン化と分解を誘導します。これらのデグレーダーが細胞内でどのように作用するかを明らかにすることは、TPDを利用した治療法の開発に不可欠です。
プロメガは、細胞内環境におけるタンパク質動態の変化を解析するためのツール、サービス、ソフトウェアを統合的に提供し、TPD研究を支援します。CRISPRで編集したHiBiTノックイン細胞を用いることで、生細胞アッセイと溶解アッセイのいずれにおいても、タンパク質量を高感度に定量できます。さらに、HiBiTベースのテクノロジーとNanoBRET®アッセイを組み合わせることで、三者複合体形成、標的タンパク質のユビキチン化、化合物の結合や細胞膜透過性を解析できます。また、HaloPROTAC3デグレーダーを用いて、標的タンパク質の除去がもたらす生物学的影響を評価できます。これらの技術は、効果的なデグレーダー化合物の特性解析と最適化を支援します。
アッセイ開発、化合物スクリーニング、プロファイリングでお困りですか?標的タンパク質分解サービスの詳細をご覧ください。
プロメガで開催された第4回TPD & Induced Proximity Symposiumには、これまで創薬標的とすることが難しかったタンパク質に、分子レベルのアプローチで挑む研究者が集まりました。一部の講演を、無料のオンデマンドウェビナーでご覧いただけます。
タンパク質デグレーダー開発で検討すべきポイント
プロメガは、効果的なタンパク質デグレーダーの開発に利用できる、細胞ベースおよび生化学的アッセイを幅広く提供しています。これらの製品を使用して、次の重要な課題を検証できます。
標的タンパク質分解
ターゲットは分解されていますか?
タグを付加した細胞または内在性タンパク質を発現する細胞を用いて、エンドポイントまたはキネティック測定によりデグレーダー活性を定量する方法をご紹介します。
細胞膜透過性と親和性
PROTACは細胞膜を透過するか?標的に対する親和性はどの程度か?
標的タンパク質およびエフェクタータンパク質に対するデグレーダーの結合を評価する、細胞ベースおよび生化学的アプローチをご紹介します。
E3 三重複合体
PROTACは三重複合体を形成するか?
リアルタイムの細胞ベースおよび生化学的アッセイを用いて、デグレーダー、標的タンパク質、E3リガーゼによる三者複合体の形成を評価する方法をご紹介します。
ユビキチン化
標的タンパク質はユビキチン化されるか?
細胞ベースおよび生化学的アプローチにより、標的タンパク質のユビキチン化を経時的にモニタリングするツールをご紹介します。
分解による表現型
標的タンパク質の分解は、表現型にどのような影響を及ぼすか?
HaloPROTAC3を用いて、標的タンパク質の分解されやすさを評価する方法をご紹介します。
注目製品
| Area of Interest | Featured Product | Application |
|---|---|---|
| Target degradation | ViaScript™ LgBiT mRNA Delivery System | Rapid, uniform intracellular LgBiT expression for live-cell kinetic analysis |
| CRISPR HiBiT Knock-In Cell Lines and Clones | Endogenously tagged targets for degradation studies under native expression | |
| Lumit® Immunoassay Cellular Systems | Quantify target protein levels in native, non-modified cells | |
| Compound permeability and target affinity | NanoBRET® TE Intracellular E3 Ligase Assays (CRBN, VHL) | E3 ligase affinity in live vs. permeabilized cells; intracellular availability |
| Ternary complex formation | CRBN and VHL Ternary Complex Assay Starter Kits | Cell-based endpoint or kinetic measurement of ternary complex formation |
| Lumit® Anti-Tag Protein Interaction Reagents | Biochemical ternary complex formation across E3 ligases and targets | |
| Target ubiquitination | NanoBRET® Ubiquitination Starter Kit | Build target-specific live-cell assays measuring all ubiquitination types |
| Lumit® Immunoassay Cellular Systems | Biochemical detection of target and E3 ligase ubiquitination | |
| Phenotypic consequence of degradation | HaloPROTAC3 | VHL-mediated degradation of HaloTag® fusions for phenotypic studies |
Nano-Glo® HiBiT Lytic Detection System
シンプルな添加-混和-測定のアッセイフォーマットで、HiBiTタグ融合タンパク質を高感度かつ広いダイナミックレンジで定量できます。
ViaScript™ LgBiT mRNA Delivery System
細胞内でLgBiTを効率よく均一に発現させ、HiBiTタグ融合タンパク質を生細胞で解析できます。
Targeted Protein Degradation Services
エンドポイントまたはキネティック測定による標的タンパク質分解、ネオサブストレートパネルのプロファイリング、三重複合体形成、ユビキチン化、細胞膜透過性/親和性評価に必要なデータを提供します。
アッセイ開発、スクリーニング、プロファイリングでお困りですか?
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