Microsatellite Instability Analysis (MSI)

Part Numbers: MD1641

研究サンプルのMSIステータスを評価

  • MSI-Highサンプルの同定において、免疫組織染色(IHC)よりも高い精度
  • 貴重なサンプルから抽出したDNAを用いた、蛍光マルチプレックスPCR法
  • 次世代シーケンス(NGS)よりも簡便、低コストかつ短時間での結果取得

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選択製品のカタログ番号: MD1641

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Microsatellite Instability Analysis (MSI)
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実績あるゴールドスタンダード法でDNAミスマッチ修復異常の研究に集中

不安定性(MSI:microsatelliteinstability)を検出するための蛍光マルチプレックスPCRを ベースにした方法です。この不安定性はDNA複製中に起こる繰返しユニットの挿入または欠失およびこれらのエラーを修正するミスマッチ修復機構(MMR:mismatchrepairsystem)の不具合によるものです。MSI分析には、通常、ガンおよび正常サンプルから増幅したマイクロサテライトマーカーのアレルプロファイルの比較が伴います。ノーマルサンプルでは認められない新しいアレルがガンサンプルに現れた場合、MSIの存在を示しています。

MSI Analysis System, Version 1.2は、マイクロサテライト不安定性(MSI)を検出するための、蛍光マルチプレックスPCR法に基づく手法です。MSIは、DNA複製中に繰り返し配列(マイクロサテライト)の塩基が挿入または欠失することによって生じるゲノム不安定性の一種であり、これらのエラーを修復すべきミスマッチ修復機構(MMR)の機能不全によって引き起こされます。

Illustration of MSI analysis in cancer research

MSI解析ワークフロー

一般的な研究用ラボにおけるMSIステータスの解析では、サンプルのインプットから結果の判定までに一晩から2日程度かかるのが一般的です。MSI Analysis Systemを使用すれば、一晩で解析可能なデータを取得することができます。

circle 1

DNA 抽出

インキュベーション込みで5時間

msi workflow maxwell purification

Maxwell® RSC 核酸自動精製装置とMaxwell® RSC FFPE DNA Kitを使用

circle 2

増幅

~3 時間

msi workflow amplification

MSI Analysis System, v1.2

circle 3

キャピラリー電気泳動

45 分

msi workflow ab3500 instrument

プロメガのSpectrum Compact CE Systemの他、Applied Biosystems® 3500、3130 Genetic Analyzerなどで解析可能

circle 4

データ解析

<1 時間

msi workflow analysis

フラグメント解析用ソフトウェアを使用

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MSIステータスの評価

MSI解析では通常、検体ペアから増幅されたマイクロサテライトマーカーのアレリックプロファイルを比較して行います。対応する正常サンプルには存在せず、異常サンプルにのみ見られるアレルが検出された場合、マイクロサテライト不安定性(MSI)が示唆されます。プロメガのMSI解析システムには、MSI-High(MSI-H)表現型の解析に適した7つのマルチプレックスマーカーが含まれています。5つはほぼモノモルフィックなモノヌクレオチドリピートマーカー(BAT-25、BAT-26、MONO-27、NR-21、NR-24)であり、もう2つは高多型性を示すペンタヌクレオチドリピートマーカー(Penta C、Penta D:これらは正常サンプルと腫瘍サンプルの照合および認証のための品質管理に使用されます)です。

腫瘍サンプル

MSI electropharogram for tumor research tissue
パネルA、B、Cは、研究同意を得た大腸がん検体を用い、Applied Biosystems® 3500 xL Genetic Analyzerで解析したものである。ソースマッチの正常対照サンプル(パネルD、E、F、右側)との比較により、BAT-26、NR-21、BAT-25、MONO-27、NR-24の各マーカーでマイクロサテライト不安定性(MSI)が確認され、MSI-High(MSI-H)と判定された。

同一ドナー由来の正常対照サンプル

MSI electropharogram for normal tissue
パネルD、E、Fは、研究同意を得た大腸がん検体と同一ドナー由来の正常対照組織を用い、Applied Biosystems® 3500 xL Genetic Analyzerで解析したものである。

免疫療法反応を予測する研究マーカーとしてのMSI

本発表は、2017年 分子病理学会(Association of Molecular Pathology)年次総会にて、James R. Eshleman博士により行われました。

MSIに関する重要な文献のご紹介

マイクロサテライト不安定性(MSI)は、遺伝学およびがん免疫研究において、ますます重要なツールとなりつつあります。DNAミスマッチ修復(MMR)機構の欠損は、遺伝性の生殖細胞系列変異や高メチル化によって引き起こされることがあります。いずれのメカニズムにおいても、MMRタンパク質の発現が阻害され、転写エラーがゲノム全体にわたって蓄積されるようになります。これらの広範なゲノム変異は、細胞の正常な機能を損ない、制御されない細胞増殖やがんの原因となりますが、同時に新たなタンパク質(異物タンパク質)を生じさせることがあります。これらの「異物」タンパク質は免疫原性を持ち、免疫エフェクター細胞をその組織へと引き寄せる可能性があります。特に、モノヌクレオチドリピート領域における不安定性や変異は、転写エラーに対して非常に鋭敏であり、MMR欠損の最初の兆候として現れることがあります。

Bacher, J.W. et al. (2004) Development of a Fluorescent Multiplex Assay for Detection of MSI-High Tumors. Disease markers 20, 237–250.
 
Le, D.T. et al. (2017) Mismatch-repair deficiency predicts response of solid tumors to PD-1 blockade. Science 10.1126/science.aan6733.
 
Le, D.T. et al. (2015) PD-1 Blockade in Tumors with Mismatch-Repair DeficiencyNew Engl. J. Med. 372, 2509–20.
 
Boland, C.R. et al. (2010) Microsatellite Instability in Colorectal Cancer. Gastroenterology 138, 2073–87.
 
Murphy, K.M. et al. (2006) Comparison of the Microsatellite Instability Analysis System and the Bethesda Panel for the Determination of Microsatellite Instability in Colorectal Cancers. J. Mol. Diagn. 8, 305–11.

GeneMapper®ソフトウェア用のMSI Panel およびBin 情報は、安定したデータ解析を実現するためにダウンロードしてご利用いただけます。これらのPanel およびBin のテキストファイルを使用することで、GeneMapper®ソフトウェア(バージョン4.0以降)によるジェノタイプの自動割り当てが可能となり、データ解析の簡略化と標準化が図れます。

製品仕様

選択製品の構成品内容

Item Part # Size Concentration Available Separately

2800M Control DNA

DD710A 1 × 25μl 10ng/μl View Product

Internal Lane Standard 600

DG107A 1 × 150μl View Product

Gold ST★R 10X Buffer

DM241C 1 × 300μl

MSI 10X Primer Pair Mix

MD174A 1 × 100μl

Nuclease-Free Water

P119A 1 × 1,250μl View Product

分析証明書

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使用制限

For Research Use Only. Not for Use in Diagnostic Procedures.

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